Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtpaQ8BWP5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtpaQ8BWP5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms