Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rd3Q8BRE0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rd3Q8BRE0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms