Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd4aQ8BIE6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd4aQ8BIE6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms