Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms