Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trmt12Q8BG71 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms