Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sv2bQ8BG39 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms