Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms