Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Lrrc27Q80YS5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc27Q80YS5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc27Q80YS5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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