Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc28Q80XJ3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc28Q80XJ3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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