Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll4Q80V24 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll4Q80V24 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms