Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms