Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp397Q7TNK4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms