Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg4Q7TMD7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms