Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms