Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3eapQ76KJ5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms