Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp8b3Q6UQ17 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b3Q6UQ17 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms