Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms