Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc4Q6S5L9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms