Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HjurpQ6PG16 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HjurpQ6PG16 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms