Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd4Q6PDQ2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd4Q6PDQ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms