Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf1Q6PDM2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf1Q6PDM2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf1Q6PDM2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf1Q6PDM2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf1Q6PDM2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf1Q6PDM2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf1Q6PDM2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms