Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms