Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen2Q6P7W5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsen2Q6P7W5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms