Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl3Q6P1Y1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms