Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf9bQ6NZA9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms