Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms