Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spin2cQ6NVE3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms