Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdcd11Q6NS46 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcd11Q6NS46 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms