Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud6aQ6IE21 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud6aQ6IE21 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms