Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KdsrQ6GV12 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KdsrQ6GV12 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms