Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms