Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms