Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sbno1Q689Z5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sbno1Q689Z5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms