Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VclQ64727 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VclQ64727 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VclQ64727 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VclQ64727 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VclQ64727 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VclQ64727 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VclQ64727 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms