Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms