Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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