Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa13Q62424 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Hoxa13Q62424 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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