Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms