Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ss18Q62280 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ss18Q62280 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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