Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms