Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms