Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd55bQ61476 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms