Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BcanQ61361 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BcanQ61361 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BcanQ61361 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BcanQ61361 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BcanQ61361 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BcanQ61361 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BcanQ61361 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms