Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms