Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmelQ60696 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmelQ60696 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmelQ60696 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms