Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2aQ60648 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms