Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Satb1Q60611 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Satb1Q60611 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms