Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms