Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc42Q5SV66 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms