Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms